Taxonomie van micro-organismen

• Microbiologie
• MBO
• Studiejaar 3

Type
micro-organismen

Indeling van micro-organismen

• Morfologie
• Culturele kenmerken

• Fysiologie

Welke van de volgende eigenschappen behoort niet tot "morfologie"?

1. Microscopische vorm
2. Macroscopische vorm
3. Grootte van de cel
4. Flagellen

Numerieke taxonomie

• Alle eigenschappen even belangrijk in de taxonomie
• Betere indeling van bacteriën 

Nieuwe inzichten

• Celwand Gram-positieve bacteriën
• Lipidesamenstelling Gram-negatieve bacteriën

Indeling van bacteriën

• Secties

Zet het vinkje op de Gram-negatieve staaf

Indeling gisten

• Morfologie
• Culturele kenmerken
• Fysiologie
• Moleculaire eigenschappen

Indeling schimmels

• Morfologie
• Culturele kenmerken
• Fysiologie
• Moleculaire eigenschappen

Indeling virussen

• Gastheer
• Type nucleinezuur
• Capside
• Envelop

Kleuring van micro-organismen

• Microscopische waarneming
• Fixatie van bacteriën
• Zure kleurstoffen -> cytoplasma
• Basische kleurstoffen -> celkern

Enkelvoudige kleuring

• Toepassen van een kleurstof om de gehele cel te kleuren

Differentiële kleuring

• Een kleurstof kleurt de verschillende onderdelen met een verschillende intensiteit

Gramkleuring

1. Kristalviolet
2. Lugol
3. Ethanol
4. Saffranine of fuchsine

Ziehl-Neelsen

• Tuberculose

1. Hete oplossing van fuchsine in fenolwater
2. Ontkleuring door zoutzuur in ethanol
3. Nakleuring met methyleenblauw of briljantgroen 

Methyleenblauw

• Methyleenblauw
• Telling van het totaal aantal kweekbare en niet-kweekbare micro-organismen

Hucker's kristalviolet-oplossing

1. Kleur een gefixeerd preparaat 1 minuut met Hucker’s kristalviolet-oplossing.
   
2.  Spoel af en droog

• Resultaat:
  paarse cellen, kleurloze sporen, alleen te zien als een “gat” in de cel.

Sporenkleuring volgens Schaeffer en Fulton   

1. Preparaat 2 minuten kleuren met malachiet-groen, terwijl preparaat verwarmd wordt
2. Spoel het preparaat met water
3. Kleur 30 seconden met saffranine 
4. Spoel met water en droog

• Resultaat: rode cellen met groene sporen

Culturele kenmerken

• grootte
  
• kleur
  
• vorm
  
• het "materiaal":
  glad, slijmerig, pluizig
• geur

Wat is geen cultureel kenmerk?

1. Vorm
2. Kleur
3. Geur
4. Gramkleuring

Fysiologische kenmerken

• Temperatuur
• Redoxpotentiaal
• pH
• Biochemische omzettingen
• Gevoeligheid ten opzichte van chemische verbindingen

Temperatuur

• Temperatuur
• Redoxpotentiaal
• pH
• Biochemische omzettingen
• Gevoeligheid ten opzichte van chemische verbindingen

Temperatuur

• Veel gebruikte temperaturen:
  5, 10, 17, 22, 30, 37, 42, 45 en 55 graden Celsius

Redoxpotentiaal

• De hoeveelheid zuurstof dat een micro-organisme kan verdragen
• Obligaat aeroob
• Obligaat anaeroob
• Facultatief anaeroob
• Micro-aerofiel
• Aerotolerante anaeroben

pH

1. Voedingsmedium steriliseren
2. 10% (steriel) wijnsteenzuur toevoegen 
3. Na enten en bebroeding controle van bacteriestam en pH

Biochemische omzettingen

• Suikers
• Polyalcoholen
• Glycosiden
• Eiwitten en aminozuren

Chemische verbindingen

• Assimilatie van chemische verbindingen 
  
• Dissimilatie van chemische verbindingen