Het verhaal begint 6 maanden nadat Thésée, een Griekse koning en de man van Phèdre, verdwenen is. Hippolyte, de zoon van Thésée, besluit de stad verlaten. Hij vertelt zijn opvoeder dat hij dit niet alleen doet om op zoek te gaan naar zijn vader, maar ook om van Aricia, een Griekse prinses, te vluchten, omdat hij verliefd op haar is. Op ditzelfde moment biecht Phèdre aan haar dienster, Œnone, op, dat ze verliefd is op Hippolyte. Daarna komt het bericht dat Thésée dood zou zijn, waardoor Phèdre’s liefde voor Hippolytus niet langer verboden zou zijn.
Hippolyte gaat langs bij Aricia en biecht zijn liefde aan haar op. Vlak daarna komt Phèdre naar Hippolyte toe en biecht zij haar liefde aan hem op, omdat dit als Thésée dood is niet langer verboden zou zijn. Hippolyte doet alsof hij het niet begrijpt en vertrekt om het gerucht dat zijn vader, Thésée, nog zou leven te onderzoeken.
Œnone vertelt Phèdre dat Thésée nog blijkt te leven. Phèdre is boos op Œnone, omdat het haar idee was om haar liefde aan Hippolyte op te biechten. Œnone komt met het idee om te zeggen dat Hippolyte Phèdre probeerde te verleiden, want Thésée zal zijn zoon een lagere straf op leggen.
Œnone vertelt Thésée dat Hippolyte zijn liefde aan Phèdre heeft opgebiecht. Hippolyte gaat naar de woedende Thésée toe en ontkent alles. Ook beweert hij verliefd te zijn op Aricia, maar Thésée gelooft dit niet en ziet het alleen als extra bewijs dat hij schuldig. Phèdre laat Hippolyte de schuld op zich nemen, omdat ze boos is dat hij verliefd is op Aricia.
Hippolyte wil samen met Aricia vertrekken. Om dit minder opvallend te maken gaat hij eerst en vertrekt zij later. Na met Aricia te hebben gesproken, die niet veel wilde vertellen, begint Thésée toch te twijfelen en nadat hij er achter komt dat Œnone zelfmoord heeft gepleegd en Phèdre niet meer wilt leven begint hij nog meer te twijfelen. Dan blijkt Hippolyte overleden te zijn tijdens een ongeluk onderweg. Thésée ziet dit als teken van de goden dat hij toch schuldig is, maar dan biecht Phèdre voor ze sterft de waarheid op. Thésée is in shock en besluit voor Aricia te zorgen als zijn eigen dochter, omdat zijn zoon van haar hield.