YV5-TH4-BS2PCR

Wat: - Herhaal replicatie
        - Polymerase Chain Reaction (PCR)
        - DNA sequencen
        - Gel elektroforese
        - DNA fingerprinting

Waarom
- Een organisme kan enkel groeien en repareren d.m.v. celdeling. Hiertoe moet DNA zorgvuldig worden gekopieerd voor de nieuwe dochter cel. 
- Wil je als wetenschapper onderzoeken wat de rol van een gen in een organisme is dan heb je grote hoeveelheden DNA kopieën van dat gen nodig.



            
         


1 / 22
volgende
Slide 1: Tekstslide
BiologieMiddelbare schoolvwoLeerjaar 5

In deze les zitten 22 slides, met interactieve quizzen, tekstslides en 1 video.

Onderdelen in deze les

Wat: - Herhaal replicatie
        - Polymerase Chain Reaction (PCR)
        - DNA sequencen
        - Gel elektroforese
        - DNA fingerprinting

Waarom
- Een organisme kan enkel groeien en repareren d.m.v. celdeling. Hiertoe moet DNA zorgvuldig worden gekopieerd voor de nieuwe dochter cel. 
- Wil je als wetenschapper onderzoeken wat de rol van een gen in een organisme is dan heb je grote hoeveelheden DNA kopieën van dat gen nodig.



            
         


Slide 1 - Tekstslide


Maak de oefening op biologiepagina en plak een screenshot van je eindresultaat hieronder.

Slide 2 - Open vraag


Maak de oefening op biologiepagina en plak een screenshot van je eindresultaat hieronder.

Slide 3 - Open vraag

Leerdoel BS2: 

- Je kunt beschrijven hoe DNA replicatie plaatsvindt
- Je kunt uitleggen hoe de PCR techniek ontwikkeld (is op basis van replicatie)
- Je kunt uitleggen op welke manier de basenvolgorde kan worden bepaald. 
- Je kunt uitleggen hoe met een bekende basenvolgorde DNA-analyse uit te voeren en verwantschap aan te tonen.

Slide 4 - Tekstslide

Zet de 7 stappen van replicatie in de juiste volgorde 
1
2
3
4
5
6
7
Primase maakt korte RNA primers die functioneren als startpunt van DNA polymerase
Ligase verbindt alle DNA fragmenten aan elkaar.
RNA primers worden vervangen door DNA nucleotiden
replicatie start bij een ori (replicatie startpunt)
single strand binding proteins voorkomen dat het dna weer dubbelstrengs wordt.
Helicase verbreekt de waterstofbruggen en maakt dsDNA ssDNA
DNA polymerase bindt een primer en verlengd deze aan de 3' uiteinde.

Slide 5 - Sleepvraag

Binas 71D

Slide 6 - Tekstslide

4

Slide 7 - Video

01:47
denaturatie - maakt het DNA enkelstrengs
annealing - primer bint aan specifiek stuk DNA dat gekopieerd wordt.
extentie - polymerase kopieert het DNA

Slide 8 - Tekstslide

02:31

Tijdens replicatie wordt DNA ook enkelstrengs gemaakt. Met behulp van welk enzym wordt DNA enkelstrengs?
A
Ligase
B
exonucelase
C
Helicase
D
Polymerase

Slide 9 - Quizvraag

03:06

Bij PCR voegt de wetenschapper de primers aan de reactie toe. Welk enzym maakt de primers tijdens replicatie?

Slide 10 - Open vraag

03:22

Door veel primers toe te voegen aan de PCR reactie en de temperatuur niet te veel te verlagen wordt voorkomen dat het DNA weer dubbelstrengs wordt. Hoe wordt dit tijdens de replicatie voorkomen?

Slide 11 - Open vraag

Polymerase Chain Reaction (PCR)

- techniek waarmee je specifieke stukken DNA kunt kopieëren.

Slide 12 - Tekstslide

doel
replicatie
PCR
replicatie startpunt
DNA enkelstrengs maken
voorkomen dat DNA weer dsDNA wordt
primers zodat DNA polymerase kan binden
DNA polymerase kopieert
RNA primers worden vervangen
ligase verbindt fragmenten
1
2
3

4

5
6

7

Slide 13 - Tekstslide

doel
replicatie
PCR
replicatie startpunt
ori
DNA enkelstrengs maken
helicase
voorkomen dat DNA weer dsDNA wordt
single strand binding proteins
bindplaats voor DNA polymerase
primase maakt RNA primers
kopieëren DNA
DNA polymerase verlengt
RNA primers vervangen voor DNA
Exonuclease + polymerase
verbinden fragmenten

ligase
1
2
3

4

5
6

7

Slide 14 - Tekstslide

doel
replicatie
PCR
replicatie startpunt
ori
niet van toepassing
DNA enkelstrengs maken
helicase
voorkomen dat DNA weer dsDNA wordt
single strand binding proteins
bindplaats voor DNA polymerase
primase maakt RNA primers
kopieëren DNA
DNA polymerase verlengt
RNA primers vervangen voor DNA
Exonuclease + polymerase
verbinden fragmenten

ligase
1
2
3

4

5
6

7

Slide 15 - Tekstslide

Binas 71M_2

Slide 16 - Tekstslide

doel
replicatie
PCR
replicatie startpunt
DNA sequentie
niet nodig
DNA enkelstrengs maken
helicase
T = 95 graden
voorkomen dat DNA weer dsDNA wordt
single strand binding proteins
niet te ver afkoelen

bindplaats voor DNA polymerase
primase maakt RNA primers
toevoegen
T = 55-60 graden
kopieëren DNA
DNA polymerase verlengt
toevoegen 
T=72 graden
RNA primers vervangen voor DNA
Exonuclease + polymerase
niet nodig want DNA primers gebruikt
verbinden fragmenten

ligase
niet nodig want kopieer maar 1 fragment
1
2
3

4

5
6

7

Slide 17 - Tekstslide

Gel elektroforese - techniek om DNA fragmenten van verschillende lengtes te scheiden en zichtbaar te maken.

Door gebruik te maken van een poreuze gel waar grote DNA moleculen langzamer doorheen migreren dan kleine DNA moleculen

Slide 18 - Tekstslide

DNA sequencen - nucleotide volgorde bepalen met behulp van PCR en gel-elektroforese

Slide 19 - Tekstslide

- DNA profielen van organismen vergelijken om zo afkomst te kunnen bepalen of organismen te kunnen identificeren 
- enzymen die specifieke DNA sequentie herkennen en hier op een unieke manier het DNA knippen

Slide 21 - Tekstslide

Huiswerk: lees blz:78 t/m 81 en maak opgave 10 t/m 16 in je digitale boek.

Doel: welke technieken zijn er ontstaan vanuit replicatie en waar kan  welke techniek voor gebruikt worden.

Slide 22 - Tekstslide